在发表科研论文的过程中,科研绘图是必不可少的,一张好看的图形会是文章很大的加分项。
为了便于使用,本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了 sciRplot 项目中,获取方式:
R 语言科研绘图模板 — sciRplot
https://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w?payreadticket=HHIqFxz_OfU0atZoOavvxF21GsCn4ZhX53iz2CB-EhqY7xdwApwAvXFOM1fu-mnJv8XJGWU本期绘图预览:

1. 导入包
我们首先导入本期绘图用到的 R 包:
library(plotrix)
2. 准备数据
接下来我们导入绘图用到的数据,在 sciRplot 中给大家提供了测试数据:
data <- sciRplot_data
查看下数据格式:

3. 准备配色
颜色的选择往往是一件让人特别纠结的事情,这里我们直接使用 sciRcolor 来设置配色:
colors <- sciRcolor::pal_scircolor(37)[1:6]
sciRcolor 是为了 R 语言科研绘图开发的配色工具,包含了 100 种常用配色,详细信息见:
R 语言科研配色工具 — sciRcolor
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkwMjM0MzA5MA==&mid=2247488147&idx=1&sn=12fd884d3cfd9108b6a913fdb3647430&scene=21&poc_token=HGhC-mijrG-KdwNBtfrL_Il4OU-eA1LsPdTUevFM
4. 绘制图形
接下来我们通过下面的代码来绘制图形:
pie3D(data, col = colors, labels = lab, explode = 0.2)
legend("top", legend = type, fill = colors, bty = "n", ncol = 3, cex = 1.5)
5. 保存图形
最后我们保存绘制的图形:
## 注意:下面保存图形代码需要在 R Console 中运行,在Rmarkdown中运行会报错
png("save/3D-pie-explode.png", width = 2000, height = 1500, res=300, units = 'px')
pie3D(data, col = colors, labels = lab, explode = 0.2)
legend("top", legend = type, fill = colors, bty = "n", ncol = 3, cex = 1.5)
dev.off()
sciRplot 介绍
为了解决 R 语言中科研绘图的问题,我推出了 sciRplot 项目。sciRplot 项目包含了以下内容:
① 100 种绘图代码,按照图形类型进行分类,包含 60 种基础绘图和 40 种进阶绘图

② 配备一站式 html文档,包含测试数据,代码一键复制,交互式阅读提高用户体验




